鹿明生物
① 1.求推荐一家靠谱的尿液代谢组学和血清代谢组学服务公司
(1) 尿液样品采集需要马上进行萃灭:快速使组织或细胞内的酶失活,防止代谢物的变化。液氮速冻是常用的萃灭方式。尿液采集后需立即放入-80℃或液氮保存。在NMR分析中,建议用0.2um滤膜过滤除菌。GC-MS分析中,由于尿素高温分解产生的氨气可能对检测其他物质造成干扰,因此分析前应加入尿素酶除去尿素。样本量要求200µL/例。LC-MS分析对样品则要求较少,仅需要弃去沉淀冻存即可。
(2)血液样品:包括血浆和血清,血清中代谢物的含量略高于血浆,血清和血浆均可用于代谢组学研究,但是取样尽量一致,要么都用血清,要么都用血浆。
血浆样品:应使用肝素钠抗凝管(EDTA等其余抗凝剂会对质谱信号有影响)采集全血,并尽快进行血浆分离:3000 rpm室温离心10 min,待血细胞完全沉降到管底后,取上层,0.2 mL/管分装至1.5 mL离心管中。-80°C冻存,干冰寄送。样本量要求100-200µL/例。
血清样品:血液收集在离心管中37°C(或室温)静置30 min或1 h进行凝固分层;3000 rpm室温离心10 min,待血细胞完全沉降到管底后,取上清转至干净的离心管中; 再12000 rpm 4°C离心10 min,取上清分装到1.5 mL离心管中,每管0.2 mL,-80 °C冻存,干冰寄送。样本量要求100-200µL/例。
现在市面上提供代谢组学的公司基本上都是基于LC-MS, GC-MS, NMR这三种技术展开。NMR技术的优点是样品可回收利用,但对复杂样品:例如血液样品的代谢组学分析,稍显力不从心,基于NMR的代谢组学数据库还没有大型的可参考标准物质谱图,这就使得解析谱图异常困难,遇到多物质的谱图重叠等问题很难解决。GC-MS由于需要样品衍生化,会有一部分物质丢失,并且由于精密度等原因,所测得的物质较少,并不能完整的反应该时刻的代谢轮廓特征。由于高分辨质谱的发展,配备有高分辨检测器的LC-MS例如LC-TOF-MS越来越成为了代谢组学样品分析的有利武器。并且随着MASSBANK, METLIN,HMDB等数据库的完善,使得LC-MS的数据的物质鉴定效率大大提升。不光如此,在样品的前处理中,使用LC-MS技术所需的处理步骤最为简单,可以很大程度上减少代谢物的流失。因此高分辨LC-MS技术已成为代谢组学中的主流手段被广泛使用。
目前国内做代谢组学的单位有很多,价格不一。如果是华北地区,可以考虑百泰派克,这家公司的价格很合理技术也挺好。
注意事项:建议尽量多的收集样本并分装冻存,100-200µL/管较为合适,且避免反复冻融。
② 哪一家公司可以代做代谢组学方面课题
1.百趣生物
成立时间:2012(最早是阿趣生物)
地点:上海
市场份额:14%
公司人数:约300人
公司介绍:国内最早专门从事代谢组学科研服务的公司之一,主打非靶标代谢组学检测分析服务,其优势是数据质量,据说能做到美国metabolon的水平,CV<10%。公司创始人源自于复旦大学及中科院,首席科学顾问为代谢组学学会秘书长、中科院朱研究员。
2.迈特维尔
成立时间:2015
地点:武汉
市场份额:14%
公司人数:约300人
公司介绍:国内最早专门从事农林作物代谢组学科研服务的公司之一,主打广泛靶向代谢组学检测分析服务,其优势是植物天然产物数据库比较完善,公司创始人源自于华中农业大学,首席科学顾问为原华中农业大学罗教授。
3.中科新生命代谢
成立时间:2004
地点:上海
市场份额:10%
公司人数:约300人
公司介绍:国内非常老牌的蛋白质组学公司,原来是中科院控股的企业,后来市场化,改由中科院营养与健康所参股,2017年左右开始做代谢组学。
4.诺禾致源质谱
成立时间:2011
地点:北京
市场份额:7%
公司人数:质谱团队约150人
公司介绍:国内测序服务龙头,2021年科创板上市,市值130亿,2018年左右开始做代谢组学,优势是销售多,很容易找到。
5.鹿明生物
成立时间:2016
地点:上海
市场份额:7%
公司人数:约100人
公司介绍:欧易生物下属企业,做蛋白质组学和代谢组学服务。欧易生物属于老牌的基因测序服务企业,最近几年发展的也很好。鹿明创始人是农科院的一名博士。
6.帕诺米克
成立时间:2012
地点:苏州
市场份额:7%
公司人数:约150人
公司介绍:苏州帕诺米克(BioNovoGene)最早是做基因检测服务的,2017左右聚焦做代谢组学,改名为诺米代谢(PanoMIX),公司2021年获得元生创投亿级融资。
7.麦特绘谱
成立时间:2016
地点:上海
市场份额:5%
公司人数:约100人
公司介绍:原交通大学贾教授创立的科研服务公司,随后贾教授在深圳设立了绘云生物,收购了麦特绘谱。鉴于贾教授在代谢组学领域资深的影响力,麦特绘谱可以提供深度的服务。
8.凯莱谱
成立时间:2016
地点:杭州
市场份额:5%
公司人数:约100人
公司介绍:上市公司迪安诊断控股公司,最早与美国Metabolon建立技术合作。创始人来自Sciex资深应用专家。公司后来独立融资,转型为临床诊断的公司,准备上市中。
9.中科脂典
成立时间:2015
地点:常州
市场份额:5%
公司人数:约50人
公司介绍:中科院遗传与发育所参股企业,创始人为中科院税研究员,税老师是国内脂质组学领域非常有影响力的专家,所以公司也是比较专注做脂质组学。
10.拜谱生物
成立时间:2017
地点:上海
市场份额:5%
公司人数:约50人
公司介绍:拜谱生物提供蛋白质组学、代谢组学、基因组学和转录组学技术服务。创始人是从中科新生命出来的行业资深人士。