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A. 包涵体纯化蛋白复性案例分析——钟鼎生物
使用IPTG诱导表达目的宴笑蛋白a。优化表达条件,将诱导条件调整至37℃,经分析目标蛋白主要呈包涵体形式。因此通过变复性的方式,重溶目标蛋白a,通过Ni柱亲和纯化获得目的蛋白。
蛋白表达鉴定结果分析
IPTG诱导蛋白表达 ,经12% SDS-PAGE分析,目标蛋白主要存在于沉淀中,结果如图所示
图1 蛋白表达鉴定SDS-PAGE分析
Fig.1 SDS-PAGE analysis of expression
M: 蛋白质分子质量标准
1: 未诱导
2: 诱导后
3: 诱导破碎后上清
4: 诱导破碎后沉淀
包涵体蛋白的变复性
1. 将菌体沉淀重悬于20 ml 裂解液 (20 mM Tris-HCl containing 1 mM PMSF and bacteria protease inhibitor cocktail, pH 8.0),超声破碎(功率晌卜含400 W,工作4sec,间歇8sec,共20min);
2. 将超声破碎的细胞裂解液4℃ 10000 g离心20 min,收集沉淀;
3. 使用包涵体洗涤液(20mM Tris,1mM EDTA,2M尿素,1M NaCl,1%Triton X-100,pH8.0)洗涤包涵体3次;
4. 用溶解缓冲液(20mM Tris,5mM DTT,8M尿素 pH8.0),按一定比例溶解包涵体,4℃放置过夜;室温,15000 rpm离心15min;
5. 将上述溶液滴加20 mM Tris-HCl ,100 mM NaCl ,pH8.0缓冲液中,逐步成倍梯度稀释缓慢搅拌,将蛋白溶液装入透析袋于20 mM Tris-HCl,100 mM NaCl,pH8.0溶液中透析过夜。
包涵体融合蛋白的Ni柱亲和纯化及结果分析
包涵体蛋白Ni柱纯化
1. 利用低压层析系统,包涵体溶液以0.5 ml/min流速上样至Ni-IDA Binding-Buffer预平衡的Ni-IDA -Sepharose CL-6B亲和层析柱;
2. 用Ni-IDA Binding-Buffer以0.5 ml/min流速冲洗,至流出液OD280值到达基线;
3. 用Ni-IDA Washing-Buffer(20 mM Tris-HCl,20 mM咪唑,0.15 M NaCl,pH8.0) 以1 ml/min流速冲洗,至流出液OD280值到达基线;
4. 用Ni-IDA Elution-Buffer(20 mM Tris-HCl,250 mM咪唑,0.15 M NaCl,pH8.0) 以1 ml/min流速洗脱目的蛋白,收集流出液;
5.上述收集的蛋白溶液加入透析袋中,使用20 mM Tris-HCl,0.15 M NaCl,pH8.0进行透析过夜;
6. 进行12% SDS-PAGE分析, 结果如Fig.2所示。
纯化结果分析
包涵体经过变复性的方式,重溶目标蛋白,通过Ni柱亲和纯化获得目标蛋白,进行12% SDS-PAGE分析。
图2 蛋白纯化SDS-PAGE分析
Fig.2 SDS-PAGE analysis of fusion protein purification
M: 蛋白质分子质量标准
1: 破碎后处理样品
2: 流出
3: 洗脱
Western Blot方法检测包涵体复性
(1) 取样品上样5 μl
(弊粗2)上样完毕后,聚丙烯酰胺凝胶先90 V跑完积层胶,再将电压升至200 V直到电泳结束。
(3)电泳结束后,取下凝胶进行转膜,恒压100 V转膜,约为1.5h,恒流250 mA
(4)电转结束后,取下膜后先用PBST洗涤4次,每次5min。
(5)将膜置于5%脱脂奶粉封闭液中封闭37℃ 1h。
(6)用封闭液稀释一抗,膜在一抗稀释液中4℃过夜。
(7)次日将膜取出后用PBST 洗膜4次,每次5 min,
(8)用含5%牛奶的封闭液稀释二抗。膜在二抗中37℃反应1h。
(9)反应完毕后,把膜取出后置于干净的盒子中洗膜4次,每次5 min。
(10) ECL显影,曝光。
Western Blot结果分析
一抗以及二抗稀释比例:
编号抗体名称稀释比例二抗名称稀释比例
1His1:1000羊抗兔1:5000
图3 蛋白Western Blot鉴定分析
Fig.3 Western Blot analysis of fusion protein purification
M: 蛋白质分子质量标准
1: 纯化后样品
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B. 南京钟鼎生物科技倒闭了吗
没有。
根据企查查查询可知,南京钟鼎生物科技截止2023年4月14日还在正常运行中,并没有倒闭。
南京钟鼎生物科技成立于2011年2月17日,公司主要经营范围包括生物技术及相关产品的研发、销售、技术咨询、技术服务等。
C. RT-PCR实验案例解析—钟鼎生物
钟鼎生物技术公司基于与客户合作的实际案例,介绍了RT-PCR的实验流程,包括RT-PCR实验所需试剂耗材、RNA提取、RNA反转录为cDNA。
实验摘要
使用TRIzol提取样品总RNA,反转录获得cDNA,供下游实验使用。
1.试剂与耗材
试剂与耗材
Prime Script II 1st Strand cDNA Synthesis Kit,宝生物工程(大连)有限公司,6210B;总RNA提取试剂TRIzol,南京钟鼎生物技术有限公司,RK01-100;
DL2000 DNA Plus Marker(100、250、500、750、1000、1500、2000 bp),南京诺唯赞生物技术有限公司,MD101。GelStain,北京全式金生物技术有限公司,GS101-01;
DEPC,Sigma公司,D5758-25ML;Agarose,西班牙Biowest,91622;
离心管,美国Axygen,311-01-051;枪头,美国Axygen;
其它试剂均为国产分析纯。
2.主要实验仪器
主要实验仪器
超微量紫外分光光度计:NanoDrop2000,Thermo公司;台式高速冷冻离心机,美国BECKMAN公司,Allegra 21R;
电子天平,美国AHOMS公司,AR5120;紫外透射仪,美国Amersham Pharmacia公司,Hofer MV-25;
电泳仪:TY2795型,BIO-RAD公司;电泳槽:Sub-Cell GT Cell,BIO-RAD公司;
凝胶成像分析系统:GelDocXR型,BIO-RAD公司;雪花状制冰机,日本SANYO公司,SIM-F140AY65;
移液器,德国Eppendorf公司。
3.实验方法及结果
3.1.RNA提取
(1)组织匀浆:向样品中加入1 ml TRIzol试剂(组织块体积不要超过TRIzol体积的10%),用移液器反复吹打。
(2)将上述匀浆液室温放置5 min,待核酸和蛋白充分解离。每1 ml TRIzol试剂用量的匀浆液中加入0.2 ml氯仿,盖紧管盖,手动剧烈震摇15 s,然后室温静置2~3 min。
(3)4℃ 10,000 g,离心10 min。
(4)小心吸取上层水相(无色)加入到新试管中,同时计算所吸取的水相体积。
(5)加入所吸取水相等体积预冷的异丙醇,盖紧管盖,轻轻摇匀。
(6)室温静置10 min,待RNA充分沉淀。
(7)4℃ 10,000 g离心10 min。
(8)将上清弃除(注意别丢弃沉淀),每管加入1 ml 75%乙醇润洗,盖紧管盖,轻轻晃动离心管,以去除残留的异丙醇和盐份。4℃ 7,500 g离心5 min。
(9)将上清弃除,打开管盖,将RNA 沉淀干燥(室温挥发或真空干燥)。注意RNA沉淀不可完全干燥,否则难以溶解。
(10)将RNA沉淀溶解于适量的无RNase水中。
3.2.RNA琼脂糖凝胶电泳分析
提取好的RNA进行琼脂糖凝胶电泳,电泳图如下所示:
3.3.RNA浓度及纯度测定
3.4.RNA反转录为cDNA
3.4.1.基因组DNA去除
采用钟鼎公司的DNase I,在RNase free的离心管中配制如下混合液:
3.4.2.反转录反应
在PCR管中配制下列反应混合液:
65℃反应5 min,冰浴冷却。
在第一步的反应管中配制下列反转录反应液:
反转录反应条件的设置:30℃ 10 min,42℃ 30 min,95℃ 5 min。冰浴冷却。产物至于-20℃冰箱保存。
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