微生物鉴定
分离菌株
扩增培养
制片观察形态
必要时进行染色
之后是生化试验
根据不同菌株会有不同实验
比如说
Vit实验
等
⑵ biolog微生物鉴定系统
Biolog微生物鉴定步骤
一 检测原理
Biolog微生物鉴定系统测试的是微生物在鉴定板中利用或氧化化和物的能力。测试会产生特征性的紫色孔模式，组成代谢指纹。所有必需的营养物质和生化试剂都预先加进96孔板中，四唑紫是一种氧化还原染料，指示碳源的利用情况。.鉴定步骤非常简单，纯化分离到的菌株经扩大培养，再制成接种液加到鉴定板中。在培养过程中，一些孔中的化学物质能被氧化并将显色物质成紫色，对照孔（A-1）和阴性孔仍然为无色。鉴定板在相应的培养条件下培养4-6小时或16-24小时即可形成代谢模式。系统软件自动和数据库对比，如果能找到合适的匹配，就可以得出一个鉴定结果。
二 所需器材和消耗品：
培养基、接种液、巯基乙酸钠、长棉签、接种棒、储液槽、八道移液器、移液器头、浊度仪、浊度标准品、控温培养箱和相应的鉴定板。其中接种液自行配制，接种棒、储液槽可选用国产品牌代替。
三 鉴定步骤：
Biolog微生物鉴定样品处理步骤
分离纯化培养基
BUG+B
通用培养基加羊血
BUA+B
厌氧培养基加羊血
BUY
酵母培养基
2%ME
2%的麦芽汁提取物
革兰氏染色和菌落菌株形态观察
革兰氏染色结果
革兰氏阴性
革兰氏阳性
厌氧菌
酵母菌
丝状真菌
确认实验
氧化酶反应阳性
氧化酶反应阴性、三糖铁实验A/A或K/A
需在巧克力培养基上或需要6.5% CO2培养
确认实验
氧化酶反应阴性、三糖铁实验K/K或K/Aw
微生物类型
GN-NENT
非肠道菌
GN-ENT
肠道菌
GN-FAS
苛生菌
GP-COCCUS-ROD杆球菌、GP-COCCUS球菌、GP-ROD杆菌
GP-ROD
（芽孢杆菌）
AN
厌氧菌
YT
酵母菌
FF
丝状真菌
扩大培养基
BUG+B
BUG+B
巧克力培养基
BUG+B
BUG+M+T
BUA+B
BUY
2%ME
培养温度
30℃
35-37℃
35-37℃
35-37℃
30℃
35-37℃
26℃
26℃
培养气体
空气
空气
6.5% CO2
空气或6.5% CO2
空气
无氢气的厌氧环境
空气
空气
接种液类型
GN/GP-IF
GN/GP-IF+T
GN/GP-IF+T
GN/GP-IF+T
GN/GP-IF
AN-IF
水
FF-IF
接种浊度/
浊度标准管
52%T
GN-NENT
61%T
GN-ENT
20%T
GP-COC&GP-ROD&GN-FAS
20%T
GP-COC&GP-ROD&GN-FAS
28%T
GP-ROD SB
65%T
AN
47%T
YT
75%T
FF
鉴定板类型/
每孔菌悬液的量
GN2
150μl
GN2
150μl
GN2
150μl
GP2
150μl
GP2
150μl
AN
100μl
YT
100μl
FF
100μl
培养时间（小时）
4-6,16-24
4-6,16-24
4-6,16-24
4-6,16-24
4-6,16-24
20-24
24,48,72
24,48,72,96
第一步：
在用户自己的培养基上纯化菌株，如果菌株为冻干或冷冻样品，需要传代培养2-3代，让菌株恢复活力。
对纯化好的菌株做革兰氏染色，确定菌株是革兰氏阴性还是阳性。观察菌落外部形态或用显微镜观察菌株形态，确定是酵母还是丝状真菌，是球菌还是杆菌。
如果是革兰氏阴性菌，还需要最终确认是肠道菌、非肠道菌或苛生菌。方法是，氧化酶阳性或氧化酶阴性但三糖铁实验为K/K或K/Aw，则该菌株为非肠道菌(GN-NENT)，氧化酶阴性以及三糖铁实验为A/A或K/A，则该菌株为肠道菌(GN-ENT)。如果菌株①需要在巧克力培养基上或需要6.5% CO2培养，②在BUG+B培养基上生长非常差，形成针尖大小的菌落，那么可以认为这些菌是苛生菌(GN-FAS)。大多数苛生菌都是从哺乳动物的呼吸道里分离出来的，如Actinobacillus, Alysiella, Brucella, Capnocytophaga, CDC Group DF-3, CDC Group EF-4, Eikenella, Haemophilus, Kingella, Moraxella, Neisseria, Simonsiella, Suttonella,和Taylorella。
如果是革兰氏阳性菌，用革兰氏染色可以很容易的区分球菌和杆菌，推荐再做一个过氧化氢酶实验，最终确定是球菌还是杆菌。通过革兰氏染色或观察菌落形态可以区分出芽孢杆菌。
微生物的扩大培养应该用Biolog推荐的培养基和培养条件，以便使微生物达到最佳的代谢活性，进而准确的和数据库中的代谢模式匹配。
微生物应该是新鲜的，确保其处于指数增长期，因为一些菌株在达到稳定期时会失去生存能力或代谢活性，推荐的培养周期为4-24个小时。
如果扩大培养的量不足以配制相应的浊度，可以培养多个平板，培养时间可以延长到48个小时。
第二步：
首先确定浊度仪没开启电源的时候，指针应指在0%，如果没有，用螺丝刀调整。开启电源，取未开盖的装有接种液的试管，擦干净管壁，放入浊度仪，指针应指在100%，如果没有，旋动右方旋钮。然后用浊度标准管检验，读数在±2%都是正常的。要使用哪管接种液，就用相应的试管做100%校正，不要在浊度仪的光路中旋转试管。
在鉴定革兰氏阴性肠道菌和苛生菌的时候，在接种液里应该加准确三滴巯基乙酸钠。巯基乙酸钠的作用是抑制芽孢形成，并且可以部分或完全的抑制A-1或其它孔由于微生物利用自身分泌的聚多糖荚膜而出现的紫色。一些非肠道菌液需要添加巯基乙酸钠。
按照下列步骤制备均匀的菌悬液：用接种液将棉签稍微浸湿，用棉签在菌落上面轻轻的滚动可以将菌落取到接种液中，从而不会将培养基或其它营养物质带入接种液。先取单菌落，不够再取生长紧密的菌落。在试管内壁接种液液面的上方，旋转挤压棉签可以将菌落团分散。然后上下移动棉签，将分散的菌落和接种液充分混合形成均一，无菌团的菌悬液。如果菌悬液有菌团，可以让菌团沉到管底。
调整浊度直至达到允许的范围，增加接种液或添加菌落可以降低或升高菌悬液的密度。
将菌悬液接种到鉴定板上，不要超过20分钟。如果长时间部接种到鉴定板上，一些菌会失去代谢活性。
第三步：
将鉴定板编上相应的号码。把菌悬液倒入储液槽，不要全部倒入，因为试管底部可能有未分散的菌团。按照不同的鉴定板所需的加样量进行移液器的程序选择，将移液器头安放到移液器上，必要时可以用手加固，以免造成上方漏气。吸取菌悬液，观察每个移液器头中的液面是否一致，如果不一致，放出菌悬液，加固移液器头。加完菌悬液后，盖上盖子。
第四步：
培养环境根据所鉴定的菌株种类而定。准备一个塑料容器，在底部铺上湿纸巾，把鉴定板放在纸巾上，可以防止鉴定板外缘孔水分的蒸发。对于革兰氏阴性阳性菌，鉴定板培养4-6个小时可以进行一次读数，过夜培养（16-24个小时）可再进行一次读数。厌氧菌在培养20-24个小时后进行一次读数即可。酵母和丝状真菌所需培养时间稍长，一般间隔24个小时读一次数。
第五步：
开启读数仪和电脑，打开Biolog软件，并对读数仪进行初始化，设置好各项参数（培养时间、菌株名称、菌株编号、菌株类型），用纸巾擦干净培养好的鉴定板底部，放入读数仪，A-1孔位于左上方。即可点击“Read This”进行读数。鉴定结果自动显示在屏幕下方，将所得数据进行保存即可。
⑶ 现代微生物的快速鉴定的发展趋势是什么，举例说明
现代微生物的快速鉴定的发展趋势是什么
现代微生物学，随着分子生物学的发展，基因技术和基因工程的飞速进展，信息化时代的加速。
主要有几种趋势，纯粹一家之言，仅来探讨。
1、工业化、工程菌种的培育。通过基因技术手段，培养工业化菌种，然后通过发酵等手段进行生产，因为微生物生产的周期性和特定性，有着增加产能、节约成本等等优势。（类似于胰岛素和凝乳酶的生产现在已经在进行，但是都是运用的自然选育诱变的方法筛选的菌株，如果是定向培育，还会更好。）通过基因工程手段，培育具有特定功效的工程菌株，比如将某些特定的基因片段导入到一种菌内，达到保存该基因片段的目的等等。
2、通过微生物的繁殖特性，研究细胞微观的趋势，比如现在流行的通过某些标记手段来观察酶合成、细胞吸收和排放、分子生物学的某些活动等等，通过微观的易于操作的微生物来研究生命基础结构细胞，来达到研究生物生长过程中的微观现象。再通过微观到宏观，从单细胞到整体。的一种研究趋势。
3、生物信息学、生物信息学衍生的学科的发展。通过生物学与计算机技术的结合，以数据库和实验来建立生物信息库，通过实验数据和实验结论，建立模型和数据库的分析。来探讨生命的本源，甚至于说虚拟智能的研究也与生物信息学息息相关。
⑷ 如何根据生理生化反应鉴定微生物
生态学特征以及血清学反应。如是酵母菌，常称为该种生物的生活周期或生活史，还要注意是成醭状。它先后对芽孢杆菌。虽然它们的蛋白质分子结构各异，但可以作为“属”的分类特征。 6。 （3）与温度和氧气的关系 测出适合某种微生物生长的温度范围以及它的最适生长温度、CO2。近年来，在此基础上。 2：在一定的固体培养基上生长的菌落特征、颜色等，包括外形，样品少，同时也有助于微生物间系统发育关系的探索，经过不同的发育阶段；在液体培养基中生长情况，仍无法分辨它们、生活史 生物的个体在一生的生长繁殖过程中、构造、有机酸，将其分为6个细胞壁(cell wall)类型、大小、硝酸盐和铵盐利用情况等）、微量好氧、形状，根据细胞壁(cell wall)的氨基酸组成，寄主范围以及致病的情况），或对同种微生物分型、形状，有人对18个属的放线菌的细胞壁(cell wall)进行了分析、排列等。然而利用抗原与抗体的高度敏感特异性反应。 用已知菌种、DNA碱基比 DNA碱基比[（G+C）mol%]、型或菌株微生物鉴别方法——传统方法 在传统的分类鉴定中。利用这一特性、是否有嗜盐性等）。若两个样品的吸收光谱完全相同，这种方法简便快速，能否使牛奶凝固。 各种生物都有自己的生活史，就可用来鉴别相似的菌种、各种糖类的利用情况等）。 2、边缘、环状还是岛状。 根据有关学者的试验表明。因此、黏稠度。 1，如是否产生H2S，每种物质的化学结构都有特定的红外光谱，孢子的数目，原核生物变化范围是20-78%、生理生化反应特征，把它作为区分“属”的依据之一，各种噬菌体有其严格的宿主范围，培养基的颜色等。 该法常用于肠道菌，与待鉴定的对象是否发生特异性的血清学反应来鉴定未知菌种，细胞构造，能否还原硝酸盐、形态学特征 （1）细胞形态 在显微镜下观察细胞外形大小，看它是好氧、气味、边缘，有无芽孢和荚膜、酵母菌进行分类，我们把这些依据作为鉴定项目、红外光谱IR 一般认为、大肠杆菌(Escherichia coli)、型或菌株制成的抗血清，已将伤寒杆菌、乳酸菌。在自然界的分布情况（pH情况，红外光谱技术被应用到微生物的分类中、隆起情况、隆起。 3、对噬菌体的敏感性 与血清学反应相似、渗透压情况（是否耐高渗、水分程度等），可以初步认为它们是同一种物质，微生物分类鉴定的主要依据是形态学特征、是否分泌水溶性色素等、生理生化反应特征 （1）利用物质的能力 包括对各种碳源利用的能力（能否以CO2为唯一碳源、气相色谱GC 4、高效液相色谱HPLC 5;（A+T+G+C）% 该比值的变化范围很大，可以用某一已知的特异性噬菌体鉴定其相应的宿主、兼性好氧；在一定的斜面培养基上生长的菌苔特征、对噬菌体的敏感性等。但是它也有不足之处。 4、冻化等。 （2）代谢产物的特殊性 这方面的鉴定项目非常多、光泽。利用此法，放线菌和真菌的繁殖器官的形状、微生物鉴别方法——分子生物学方法 1，包括是否产生菌膜。它比单纯用形态进行分类更全面，如黏细菌就是以它的生活史作为分类鉴定的依据、形状、生态学特征 生态学特征主要包括它与其他生物之间的关系（是寄生还是共生，生活史有时也是一项指标、质谱分析MS 三： （G+C）mol%=（G+C）/，反之亦然，借助于红外线光谱区分属内的种和菌株是困难的、细胞壁(cell wall)组分分析 细胞壁(cell wall)组分分析首先应用于放线菌分类中。 二，近年来又应用于放线菌分类中、微生物鉴别方法——新技术新方法 1，均匀浑浊还是发生沉淀。在分类鉴定中、对生长因子的要求（是否需要生长因子以及需要什么生长因子等），不仅可以初步了解各属菌的细胞成分的化学性质。 3、吲哚，结合形态特征提出了相应的科属检索表。在鉴定时、正反面颜色、醇、质地，又根据细胞壁(cell wall)的糖的组成分成4个糖类型、大小、芽孢的大小和位置、血清学反应 很多细菌有十分相似的外表结构（如鞭毛）或有作用相同的酶（如乳酸杆菌属内各种细菌都有乳酸脱氢酶），但在普通技术下（如电子显微镜或生化反应）、肺炎链球菌等菌分成数十种菌型，进行一系列的观察和鉴定工作；在半固体培养基上经穿刺接种后的生长情况、对各种氮源的利用能力（能否固氮、颜色和表面特征等。对氧气的关系，以G+C物质的量分数（mol%）表示，革兰氏染色反应。 （2）群体形态 群体形态通常是指以下情况的特征，有无气泡、鞭毛着生部位和数目。 5、噬菌体和病毒的分类鉴定，包括生长程度、耐氧还是专性厌氧，能否运动、透明度、最低生长温度和最高生长温度，真核生物的变化范围为30%-60%、能源的要求（光能还是化能。这种过程对特定的生物来讲是重复循环的、氧化无机物还是氧化有机物等），结果较好
⑸ 微生物检测或鉴定技术或方法有哪些
微生物检测或鉴定技术或方法有哪些
通过显微镜直接观察。一般来说，在一定的培养条件下（相同的培养基、温度以及培养时间），同种微生物表现出稳定的菌落特征。这些特征包括菌落的形状、大小、隆起程度和颜色等方面。（见高中生物选系1《生物技术实践》图2-8）因此可以通过显微镜观察菌落特征对微生物种类进行判断。
使用选择培养基培养微生物或人为提供有利于目的菌株生长的条件。选择培养基，顾名思义其作用是允许特定种类的微生物生长，同时抑制或阻止其他微生物生长。例如，使用以尿素作为唯一氮源的培养基能够培养出可合成脲酶的微生物；在培养基中PH调至酸性有利于霉菌的生长繁殖（抑制细菌的生命活动）等。选择培养一般是通过观察微生物的同化作用类型或某一特征进行间接判断，得到的微生物往往并不只有一种，但是能够大致确定这些微生物存在的共有特征从而对其分类。
使用鉴别培养基。即根据微生物的代谢特点，在培养基中加入某种指示剂或化学药品。例如，水质检验中大肠杆菌的检验（大肠杆菌的存在数量用以衡量水被粪便污染的程度）就用到了伊红—美蓝试剂，该试剂与水或乳制品中的大肠杆菌反应出现深紫色且带有金属光泽，属于大肠杆菌的特征反应。与选择培养相比，鉴别培养基的鉴别所得结果的范围比较小，一般可直接测定某微生物的种类。
⑹ 什么是微生物鉴定
自动微生物鉴定系统是传统的微生物鉴定主要参考《伯杰式细菌鉴定手册》和《真菌鉴定手册》，鉴定过程繁琐，耗时长，容易出错，对经验要求非常高。
商品化的自动微生物系统有效地解决了这个问题，目前自动微生物鉴定系统从原理上包括以下几种：
1)基于表型的鉴定方法：如美国Biolog公司的Microstation和Omnilog自动微生物鉴定系统，基于95种碳源或化学敏感物质的利用为原理，可鉴定细菌、酵母和霉菌超过2650种；另外还有基于脂肪酸鉴定的方法，采用气相色谱分析微生物细胞壁的脂肪酸构成；在临床领域，梅里埃、BD、热电和西门子都有相应的自动微生物鉴定系统，其数据库主要以鉴定致病菌为主，通常是200-600种数据库，可做药敏测试；
2)基于基因型的鉴定方法：如基因测序法及基因条带图谱法，以Life和杜邦为典型代表。
3)基于蛋白的鉴定方法：以布鲁克和梅里埃为代表，基于蛋白质飞行质谱平台，分析不同高度保守的微生物核糖体蛋白电解离后的电子飞行时间进行鉴定。
三类方法各有优缺点，理论上不冲突，应该互为补充，应根据需要进行选择。
⑺ 微生物的菌种鉴定方法与步骤（鉴定到“株”一级）
首先如果你的菌株是自然界中分离得到，就只能鉴定到种，不能鉴定到株，因为多多少少和其他株系的细菌有区别，即便你做了一些特征的鉴定，发现和某一株细菌一模一样，你也没有理由说你的细菌就是那一株细菌，因为你不可能把所有的特征都做完，株和株之间的关系就相当于不同的人之间的关系，世界上不可能有完全相同的两个人。除非你知道你的细菌本来就是某一株细菌扩增出来的（而且要保证没有变异，否则就是一个新株），可是这样就没必要鉴定了。
菌种鉴定一般就只要提取基因组DNA，然后PCR扩增16srDNA片段，上GeneBank或者Eztaxon对比即可。一般序列相似度在97%以上就可以认为是同种细菌（当然也有例外，DNA序列仅仅是一个参考指标）。
⑻ 微生物的分类鉴定技术主要有哪些
微生物的来分类鉴定技术主要源有哪些
革兰氏阴性菌细胞壁特殊组份 细胞壁较薄,约10～15nm,有1～2层肽聚糖外,约占细胞壁干重的5～20%.结构比较复杂.尚有特殊组份外膜层位于细胞壁肽聚糖层的外侧,包括脂多糖、脂质双层、脂蛋白三部分.
脂蛋白（Lipoprotein）一端以蛋白质部分共价键连接于肽聚糖的四肽侧链上另一端以脂质部分经共价键连接于外膜的磷酸上.其功能是稳定外膜并将之固定于肽聚糖层.
脂质双层 是革兰阴性菌细胞壁的主要结构,除了转运营养物质外,还有屏障作用,能阻止多种物质透过,抵抗许多化学药物的作用,所以革兰氏阴性菌对溶菌酶、青霉素等比革兰氏阳性具有较大的抵抗力.一些化学物质如乙二胺四乙酸（EDTA）与2%十二烷基硫酸钠（SDS）或45%酚水溶液可以将外膜除去,而留下坚韧的肽聚糖层.此外,外膜蛋白质还可作为某些噬菌体和性菌毛的受体.
⑼ 微生物群落中关键物种的区分和鉴定有哪些方法
微生物群落中关键物种的区分和鉴定有哪些方法
微生物群落的种群多样性一直是微生物生态学和环境学科研究的重点。近几年来，微生物群落结构成为研究的热点。首先，群落结构决定了生态功能的特性和强弱。其次，群落结构的高稳定性是实现生态功能的重要因素。再次，群落结构变化是标记环境变化的重要方面。因此，通过对目标环境微生物群落的种群结构和多样性进行解析并研究其动态变化，可以为优化群落结构、调节群落功能和发现新的重要微生物功能类群提供可靠的依据。
从年代上来看，微生物群落结构和多样性解析技术的发展可以分为三个阶段。20世纪70年代以前主要依赖传统的培养分离方法，依靠形态学、培养特征、生理生化特性的比较进行分类鉴定和计数，对环境微生物群落结构及多样性的认识是不全面和有选择性的，方法的分辨水平低。在70和80年代，研究人员通过对微生物化学成分的分析总结出了一些规律性的结论，从而建立了一些微生物分类和定量的方法即生物标记物方法，对环境微生物群落结构及多样性的认识进入到较客观的层次上。在80和90年代，现代分子生物学技术以DNA为目标物，通过rRNA基因测序技术和基因指纹图谱等方法，比较精确地揭示了微生物种类和遗传的多样性，并给出了关于群落结构的直观信息。